Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF428Q96B54 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms