Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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CCDC47Q96A33 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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CCDC47Q96A33 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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CCDC47Q96A33 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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CCDC47Q96A33 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC47Q96A33 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
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