Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNPO1Q92973 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms