Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNRQ92752 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TNRQ92752 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNRQ92752 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNRQ92752 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNRQ92752 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNRQ92752 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNRQ92752 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNRQ92752 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNRQ92752 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TNRQ92752 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNRQ92752 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNRQ92752 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNRQ92752 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TNRQ92752 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNRQ92752 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNRQ92752 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNRQ92752 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNRQ92752 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNRQ92752 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNRQ92752 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNRQ92752 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNRQ92752 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNRQ92752 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNRQ92752 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNRQ92752 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNRQ92752 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNRQ92752 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNRQ92752 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TNRQ92752 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNRQ92752 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNRQ92752 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNRQ92752 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNRQ92752 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNRQ92752 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TNRQ92752 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNRQ92752 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNRQ92752 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNRQ92752 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNRQ92752 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNRQ92752 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNRQ92752 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNRQ92752 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNRQ92752 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TNRQ92752 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNRQ92752 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNRQ92752 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TNRQ92752 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNRQ92752 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNRQ92752 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNRQ92752 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNRQ92752 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNRQ92752 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNRQ92752 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNRQ92752 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNRQ92752 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNRQ92752 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNRQ92752 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TNRQ92752 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNRQ92752 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNRQ92752 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNRQ92752 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TNRQ92752 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNRQ92752 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNRQ92752 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNRQ92752 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNRQ92752 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNRQ92752 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNRQ92752 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNRQ92752 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNRQ92752 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNRQ92752 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNRQ92752 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TNRQ92752 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNRQ92752 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNRQ92752 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TNRQ92752 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TNRQ92752 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNRQ92752 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNRQ92752 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNRQ92752 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNRQ92752 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNRQ92752 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNRQ92752 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNRQ92752 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNRQ92752 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNRQ92752 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNRQ92752 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNRQ92752 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNRQ92752 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNRQ92752 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNRQ92752 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNRQ92752 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNRQ92752 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TNRQ92752 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNRQ92752 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNRQ92752 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNRQ92752 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TNRQ92752 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TNRQ92752 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms