Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMPDL3AQ92484 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMPDL3AQ92484 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms