Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TRIM41Q8WV44 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TRIM41Q8WV44 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms