Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMIEQ8NEW7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMIEQ8NEW7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms