Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW8

TTC21A, Tetratricopeptide repeat protein 21A, humanhuman

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21AQ8NDW8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TTC21AQ8NDW8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TTC21AQ8NDW8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms