Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ANKRD53Q8N9V6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms