Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AMER3Q8N944 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms