Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CRACR2BQ8N4Y2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms