Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDCL2Q8N4E4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDCL2Q8N4E4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms