Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPAP2Q8IXW5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms