Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATG4DQ86TL0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATG4DQ86TL0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms