Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LRRC9Q6ZRR7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms