Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFXL1Q6ZNB6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFXL1Q6ZNB6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms