Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB5

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6ZNB5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q6ZNB5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q6ZNB5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q6ZNB5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q6ZNB5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Q6ZNB5 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Q6ZNB5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q6ZNB5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Q6ZNB5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q6ZNB5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Q6ZNB5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Q6ZNB5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q6ZNB5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q6ZNB5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q6ZNB5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q6ZNB5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q6ZNB5 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q6ZNB5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q6ZNB5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Q6ZNB5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Q6ZNB5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q6ZNB5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms