Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOXD4L3Q6VB84 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FOXD4L3Q6VB84 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms