Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ3

CD300LD, CMRF35-like molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300LDQ6UXZ3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CD300LDQ6UXZ3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD300LDQ6UXZ3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD300LDQ6UXZ3 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD300LDQ6UXZ3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD300LDQ6UXZ3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD300LDQ6UXZ3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD300LDQ6UXZ3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD300LDQ6UXZ3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD300LDQ6UXZ3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD300LDQ6UXZ3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD300LDQ6UXZ3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD300LDQ6UXZ3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD300LDQ6UXZ3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CD300LDQ6UXZ3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms