Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP12Q6UXS9 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms