Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LRIG3Q6UXM1 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms