Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMCO3Q6UWJ1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMCO3Q6UWJ1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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