Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC4A10Q6U841 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC4A10Q6U841 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms