Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A47Q6Q0C1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A47Q6Q0C1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms