Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
WSCD1Q658N2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
WSCD1Q658N2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms