Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXH4

PRAMEF6, PRAME family member 6, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6Q5VXH4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRAMEF6Q5VXH4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PRAMEF6Q5VXH4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms