Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOCADQ5VW36 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOCADQ5VW36 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms