Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOGA3Q5TF21 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOGA3Q5TF21 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms