Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC183Q5T5S1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms