Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CC2D1BQ5T0F9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CC2D1BQ5T0F9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CC2D1BQ5T0F9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CC2D1BQ5T0F9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CC2D1BQ5T0F9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CC2D1BQ5T0F9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CC2D1BQ5T0F9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CC2D1BQ5T0F9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CC2D1BQ5T0F9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CC2D1BQ5T0F9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CC2D1BQ5T0F9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CC2D1BQ5T0F9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CC2D1BQ5T0F9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CC2D1BQ5T0F9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CC2D1BQ5T0F9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CC2D1BQ5T0F9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms