Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TDRD12Q587J7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TDRD12Q587J7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms