Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PDLIM3Q53GG5 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PDLIM3Q53GG5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms