Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTXN3Q4LDR2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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