Protein–RNA interactions for Protein: Q49MI3

CERKL, Ceramide kinase-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKLQ49MI3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CERKLQ49MI3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CERKLQ49MI3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CERKLQ49MI3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CERKLQ49MI3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CERKLQ49MI3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CERKLQ49MI3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms