Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ANKRD55Q3KP44 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms