Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
C17orf58Q2M2W7 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C17orf58Q2M2W7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms