Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFX7Q2KHR2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms