Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
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COL24A1Q17RW2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
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COL24A1Q17RW2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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COL24A1Q17RW2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
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COL24A1Q17RW2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL24A1Q17RW2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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COL24A1Q17RW2 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
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COL24A1Q17RW2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL24A1Q17RW2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
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