Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME3Q16798 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME3Q16798 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME3Q16798 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME3Q16798 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME3Q16798 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME3Q16798 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME3Q16798 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME3Q16798 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ME3Q16798 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME3Q16798 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ME3Q16798 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME3Q16798 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME3Q16798 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ME3Q16798 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME3Q16798 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME3Q16798 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME3Q16798 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME3Q16798 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME3Q16798 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME3Q16798 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME3Q16798 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME3Q16798 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME3Q16798 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME3Q16798 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME3Q16798 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME3Q16798 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME3Q16798 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME3Q16798 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME3Q16798 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME3Q16798 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME3Q16798 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME3Q16798 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ME3Q16798 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME3Q16798 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME3Q16798 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME3Q16798 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ME3Q16798 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ME3Q16798 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ME3Q16798 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
ME3Q16798 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME3Q16798 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME3Q16798 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME3Q16798 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME3Q16798 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME3Q16798 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME3Q16798 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME3Q16798 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME3Q16798 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME3Q16798 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME3Q16798 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME3Q16798 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ME3Q16798 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME3Q16798 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME3Q16798 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME3Q16798 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME3Q16798 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ME3Q16798 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME3Q16798 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME3Q16798 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME3Q16798 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ME3Q16798 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME3Q16798 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME3Q16798 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME3Q16798 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ME3Q16798 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ME3Q16798 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ME3Q16798 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ME3Q16798 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME3Q16798 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME3Q16798 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME3Q16798 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME3Q16798 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ME3Q16798 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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