Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FOXD1Q16676 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
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FOXD1Q16676 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC28■■■□□ 2.07
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FOXD1Q16676 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
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FOXD1Q16676 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 AC073115.1-201ENST00000436056 532 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
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FOXD1Q16676 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
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FOXD1Q16676 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
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FOXD1Q16676 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 AC012181.2-201ENST00000570210 699 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXD1Q16676 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
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