Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SF1Q15637 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SF1Q15637 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SF1Q15637 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SF1Q15637 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SF1Q15637 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SF1Q15637 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SF1Q15637 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SF1Q15637 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SF1Q15637 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SF1Q15637 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SF1Q15637 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SF1Q15637 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SF1Q15637 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SF1Q15637 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SF1Q15637 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SF1Q15637 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SF1Q15637 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SF1Q15637 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SF1Q15637 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SF1Q15637 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SF1Q15637 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SF1Q15637 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SF1Q15637 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SF1Q15637 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SF1Q15637 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SF1Q15637 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SF1Q15637 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SF1Q15637 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SF1Q15637 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SF1Q15637 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SF1Q15637 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SF1Q15637 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SF1Q15637 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SF1Q15637 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SF1Q15637 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SF1Q15637 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SF1Q15637 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SF1Q15637 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SF1Q15637 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SF1Q15637 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SF1Q15637 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SF1Q15637 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SF1Q15637 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SF1Q15637 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SF1Q15637 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SF1Q15637 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SF1Q15637 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SF1Q15637 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SF1Q15637 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SF1Q15637 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms