Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF1AQ15573 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF1AQ15573 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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