Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE3CQ15386 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBE3CQ15386 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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