Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PTPRRQ15256 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTPRRQ15256 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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