Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
R3HDM1Q15032 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
R3HDM1Q15032 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
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