Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MDC1Q14676 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MDC1Q14676 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MDC1Q14676 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MDC1Q14676 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MDC1Q14676 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MDC1Q14676 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MDC1Q14676 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MDC1Q14676 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MDC1Q14676 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
MDC1Q14676 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MDC1Q14676 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
MDC1Q14676 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
MDC1Q14676 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MDC1Q14676 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MDC1Q14676 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MDC1Q14676 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MDC1Q14676 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MDC1Q14676 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MDC1Q14676 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
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