Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CBFBQ13951 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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