Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCINQ13939 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCINQ13939 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCINQ13939 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCINQ13939 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCINQ13939 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCINQ13939 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCINQ13939 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCINQ13939 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCINQ13939 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCINQ13939 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCINQ13939 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCINQ13939 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCINQ13939 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCINQ13939 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCINQ13939 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCINQ13939 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCINQ13939 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCINQ13939 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCINQ13939 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCINQ13939 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCINQ13939 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCINQ13939 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCINQ13939 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCINQ13939 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCINQ13939 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCINQ13939 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCINQ13939 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCINQ13939 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCINQ13939 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCINQ13939 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCINQ13939 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCINQ13939 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCINQ13939 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCINQ13939 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCINQ13939 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCINQ13939 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCINQ13939 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCINQ13939 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCINQ13939 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCINQ13939 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCINQ13939 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCINQ13939 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCINQ13939 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCINQ13939 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCINQ13939 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCINQ13939 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCINQ13939 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCINQ13939 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CCINQ13939 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCINQ13939 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CCINQ13939 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCINQ13939 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCINQ13939 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCINQ13939 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCINQ13939 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCINQ13939 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCINQ13939 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCINQ13939 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCINQ13939 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCINQ13939 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCINQ13939 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCINQ13939 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCINQ13939 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCINQ13939 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCINQ13939 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCINQ13939 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCINQ13939 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCINQ13939 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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