Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CUL3Q13618 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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