Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TCIRG1Q13488 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TCIRG1Q13488 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
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